MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.02

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019692	AACT	2	8	789	796	50 %	25 %	0 %	25 %	428223449
2	NC_019692	TAACT	2	10	825	834	40 %	40 %	0 %	20 %	428223449
3	NC_019692	CTA	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223449
4	NC_019692	CTTT	2	8	1238	1245	0 %	75 %	0 %	25 %	428223450
5	NC_019692	TCT	2	6	1302	1307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223450
6	NC_019692	TAA	2	6	1359	1364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223450
7	NC_019692	AGT	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223450
8	NC_019692	ATT	2	6	1409	1414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223450
9	NC_019692	A	6	6	1665	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	428223450
10	NC_019692	GTA	2	6	1677	1682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223450
11	NC_019692	CTT	2	6	1693	1698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223450
12	NC_019692	CTA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223450
13	NC_019692	ACC	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223451
14	NC_019692	T	6	6	2433	2438	0 %	100 %	0 %	0 %	428223451
15	NC_019692	ATT	3	9	2468	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
16	NC_019692	TC	3	6	2559	2564	0 %	50 %	0 %	50 %	428223451
17	NC_019692	ATC	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
18	NC_019692	TTAA	2	8	3042	3049	50 %	50 %	0 %	0 %	428223451
19	NC_019692	CAAAC	2	10	3100	3109	60 %	0 %	0 %	40 %	428223451
20	NC_019692	GTAGA	2	10	3148	3157	40 %	20 %	40 %	0 %	428223451
21	NC_019692	ACTGA	2	10	3162	3171	40 %	20 %	20 %	20 %	428223451
22	NC_019692	GATA	2	8	3218	3225	50 %	25 %	25 %	0 %	428223451
23	NC_019692	CGT	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
24	NC_019692	CTT	2	6	3371	3376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223451
25	NC_019692	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223451
26	NC_019692	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223451
27	NC_019692	GCT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
28	NC_019692	GACTCA	2	12	3525	3536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428223451
29	NC_019692	GAGTT	2	10	3611	3620	20 %	40 %	40 %	0 %	428223451
30	NC_019692	CAGA	2	8	3631	3638	50 %	0 %	25 %	25 %	428223451
31	NC_019692	GCT	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
32	NC_019692	TGA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
33	NC_019692	TCG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
34	NC_019692	CAT	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
35	NC_019692	ACA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223451
36	NC_019692	ATT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
37	NC_019692	CCG	2	6	4036	4041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223451
38	NC_019692	ATT	2	6	4184	4189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
39	NC_019692	GTC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
40	NC_019692	CCTTG	2	10	4243	4252	0 %	40 %	20 %	40 %	428223451
41	NC_019692	CT	3	6	4318	4323	0 %	50 %	0 %	50 %	428223451
42	NC_019692	GAT	3	9	4376	4384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
43	NC_019692	CTA	2	6	4453	4458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
44	NC_019692	T	7	7	4483	4489	0 %	100 %	0 %	0 %	428223451
45	NC_019692	TTA	2	6	4504	4509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
46	NC_019692	GAT	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
47	NC_019692	TGAT	2	8	4597	4604	25 %	50 %	25 %	0 %	428223451
48	NC_019692	ACT	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
49	NC_019692	GATC	2	8	4703	4710	25 %	25 %	25 %	25 %	428223451
50	NC_019692	ATTGGC	2	12	4742	4753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428223451
51	NC_019692	TGA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
52	NC_019692	AAAT	2	8	4859	4866	75 %	25 %	0 %	0 %	428223451
53	NC_019692	GAGGTA	2	12	4991	5002	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428223452
54	NC_019692	TGA	2	6	5170	5175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223452
55	NC_019692	T	7	7	5269	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	428223452
56	NC_019692	AAT	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223453
57	NC_019692	AAGGA	2	10	5718	5727	60 %	0 %	40 %	0 %	428223453
58	NC_019692	ATTTT	2	10	5749	5758	20 %	80 %	0 %	0 %	428223453
59	NC_019692	T	7	7	5755	5761	0 %	100 %	0 %	0 %	428223453
60	NC_019692	GAC	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223453
61	NC_019692	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223453
62	NC_019692	A	6	6	5797	5802	100 %	0 %	0 %	0 %	428223453
63	NC_019692	CT	3	6	5929	5934	0 %	50 %	0 %	50 %	428223453
64	NC_019692	CAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223453
65	NC_019692	CCAA	2	8	5954	5961	50 %	0 %	0 %	50 %	428223453
66	NC_019692	CT	3	6	6057	6062	0 %	50 %	0 %	50 %	428223453
67	NC_019692	ATT	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223453
68	NC_019692	TTA	2	6	6091	6096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223453
69	NC_019692	CCAAT	2	10	6124	6133	40 %	20 %	0 %	40 %	428223453
70	NC_019692	ATT	2	6	6153	6158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223453
71	NC_019692	AAG	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223454
72	NC_019692	AAT	2	6	6464	6469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223454
73	NC_019692	TCC	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223454
74	NC_019692	AGA	2	6	6899	6904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223455
75	NC_019692	ATT	2	6	6926	6931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223455
76	NC_019692	GAT	2	6	6949	6954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223455
77	NC_019692	TC	3	6	7089	7094	0 %	50 %	0 %	50 %	428223455
78	NC_019692	CAAG	2	8	7095	7102	50 %	0 %	25 %	25 %	428223455
79	NC_019692	TGGCT	2	10	7159	7168	0 %	40 %	40 %	20 %	428223455
80	NC_019692	AGTG	2	8	7205	7212	25 %	25 %	50 %	0 %	428223455
81	NC_019692	TGAT	2	8	7227	7234	25 %	50 %	25 %	0 %	428223455
82	NC_019692	ATG	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223455
83	NC_019692	TCA	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223455
84	NC_019692	CGC	2	6	7727	7732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223456
85	NC_019692	CAA	2	6	7739	7744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223456
86	NC_019692	TAA	2	6	7897	7902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223456
87	NC_019692	ATG	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223456
88	NC_019692	GAA	2	6	7940	7945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223456
89	NC_019692	CAGAT	2	10	8014	8023	40 %	20 %	20 %	20 %	428223456
90	NC_019692	GA	3	6	8301	8306	50 %	0 %	50 %	0 %	428223457
91	NC_019692	TTTG	2	8	8378	8385	0 %	75 %	25 %	0 %	428223457
92	NC_019692	TGATT	2	10	8502	8511	20 %	60 %	20 %	0 %	428223458
93	NC_019692	ATC	2	6	8702	8707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223458
94	NC_019692	T	6	6	9172	9177	0 %	100 %	0 %	0 %	428223459
95	NC_019692	ATT	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223459
96	NC_019692	GCG	2	6	9370	9375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223459
97	NC_019692	AG	3	6	9410	9415	50 %	0 %	50 %	0 %	428223459
98	NC_019692	TGA	2	6	9447	9452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223459
99	NC_019692	GT	3	6	9491	9496	0 %	50 %	50 %	0 %	428223459
100	NC_019692	ATG	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223459
101	NC_019692	A	6	6	9631	9636	100 %	0 %	0 %	0 %	428223459
102	NC_019692	TCAGT	2	10	9852	9861	20 %	40 %	20 %	20 %	428223460
103	NC_019692	ACT	2	6	9934	9939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223460
104	NC_019692	T	7	7	9991	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	428223460
105	NC_019692	GTT	2	6	10188	10193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223460

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.